弱起(例えば4/4拍子の曲の1小節目だけが2拍しかないこと)の設定方法がわかりません。
残念ながら弱起の設定はできません。
しかし、ご質問の例の場合、1小節目のみ2/4拍子に設定することで入力も演奏も問題なく行えるようになります。
具体的な設定手順は、まずNote Editorの[設定]メニューの[調・拍子・小節幅]をクリックすると表示されるダイアログボックスで、[設定する小節]を「1」に、[拍子]を「2/4」に変更し[適用]ボタンをクリックします。
次に、[設定する小節]を「2」に、[拍子]を「4/4」に変更し[OK]ボタンをクリックします。以降は、普通に音符を入力して行ってください。